流程

在学习生信的过程中，总是听说流程啊，管道啊，pipeline啊，到底这些意味着什么？你能把测序数据从ncbi下载下来，这不叫流程；你可以继续把数据做完质控，然后搞个比对，再做做什么差异分析啊、富集分析啊、各种类型数据的联合分析啊，这也不叫流程，谁知道你中间因为某个包安装用了多久的时间，谁晓得你这个过程是不是 reproducible 的？要是你中间出了问题怎么办，可控性如何？监控性如何？要是这些问题都能解答，我想就应该可以叫做一个流程了吧，流程化、自动化、可控化、高复用化。作为一个新人，要独自解决这些功能还是有些困难，肯定需要“假于物”的，恰好那天看到有个朋友说到用snakemake来些流程，哈哈，这不就有了，下面就说一说我初步学习使用的理解吧。